试管婴儿的受精方式是体外，自然受孕的受精是体内。
试管婴儿和自然受孕的受精方式不同，试管婴儿是通过提取精子、卵子在体外完成受精，然后将发育到一定程度的胚胎移植到女性子宫内完成受孕生育的方式，而自然受孕则是通过体内受精，精子、卵子相结合，然后实现自然受孕生育的方式。
其次是做试管婴儿一般会筛选优质的精子和卵子，对于父母双方中存在染色体结构或者数目异常，以及患有地中海贫血、血友病等遗传性疾病的夫妇，如果通过试管婴儿的方式进行受孕，可在一定程度上避免先天性患儿的出现，但如果是自然受孕的话，孩子出生时有可能出现父母具有的遗传性疾病。
除此之外，试管婴儿和自然受孕两种方式出生的宝宝，并不会有任何差异，也不存在两者出生的宝宝谁比谁更聪明一说。
